武汉疫情开始刷屏，各路“伪专家”“伪科学文章”充实网络，今天我用生物信息学方法来回答新型冠状病毒的前世今生以及分子生物学机制。

生物信息学是利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。

可以通过生信的方法研究武汉冠状病毒的起源和原生宿主，并评估这种新型冠状病毒在物种间或人类之间传播的公共健康风险。

武汉CoV的6个基因组序列几乎完全相同。与SARS-CoV和MERS-CoV的基因组相比，用作武汉冠状病毒代表的WH-human_1基因组与SARS-CoV的基因组具有比MERS-CoV更好的序列同源性。可以认为武汉Cov与SARS-CoV具有共同的起源。

武汉地区的冠状病毒在系统发育树中呈聚类分布，属于Beta冠状病毒属(Betacoronavirus) 。Beta冠状病毒属是一种有包膜的单链RNA病毒，可感染野生动物，畜群和人类，导致偶发性疾病爆发，但更多时候感染后无明显症状。武汉CoV群位于SARS和类SARS冠状病毒群中，蝙蝠冠状病毒HKU9-1为最接近的外类群。它的内部共同的邻居是SARS或类SARS冠状病毒，包括感染人类的冠状病毒。大多数内部共同的邻居和外类群都在作为自然宿主的各类蝙蝠中有发现，因此，蝙蝠是武汉冠状病毒的原生宿主，尽管在蝙蝠向人类的传播过程中仍然可能存在中间宿主。根据武汉CoVs独特的系统发育位置，它们可能与SARS/类SARS冠状病毒共享一个共同的祖先，类似于蝙蝠冠状病毒HKU9-1。

病毒存在地球都已经很久的时间，多达数亿年之久，他们有一个自然宿主，与宿主共生于体内，相安无事。但这些病毒一旦离开自然宿主，在另一个生物体内附着并开始复制，就有可能破坏另一个生物免疫的平衡，形成扩散和疾病 。由于病毒是非细胞的，无法通过细胞分裂的方式来完成数量增长；它们是利用宿主细胞内的代谢工具来合成自身的拷贝，并完成病毒组装。病毒衣壳蛋白与宿主细胞表面特定受体之间发生特异性结合。这种特异性决定了一种病毒的宿主范围。武汉CoV S蛋白的RBD域支持与人类ACE2分子的强相互作用，尽管它与SARS-CoV S蛋白的序列存在多样性。因此，武汉CoV通过S-蛋白ACE2结合途径对人类传播构成了重大的公共卫生风险。

通过生物信息学的方法我们了解到武汉CoV的起源，与SARS MERS的种属关系以及分子传播学机制，为尽快确认传染源和传播途径、制定高效的防控策略和治疗方案提供了科学理论依据。所以不要惊慌，2003年的医疗条件和生信技术远没有现在好，我们都可以应对，相信不会太久疫情就会控制住。

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