很多人认为转氨酶升高就意味着肝功能不好了，需要吃药把转氨酶降下来，转氨酶降下来肝功能也就好了。不少人把转氨酶作为肝功能的代名词，用来评估肝脏疾病的严重程度，把能够降转氨酶的药叫“保肝药”。这其中存在很大的误区，转氨酶不能完全代表“肝功能”，不能反映肝脏疾病的严重程度。比如，肝硬化甚至肝癌是比较严重的肝脏疾病，但是患者的转氨酶水平可能是正常的。另外，有个名词叫“酶胆分离”，肝病患者转氨酶水平逐渐下降，但是胆红素水平却持续升高，这种情况反而预示着肝功能坏转，是预后差的表现。

转氨酶是肝细胞损伤比较敏感的指标，当某些伤肝因素（比如药物，病毒，酒精，免疫等）导致肝细胞明显受损时常常伴有转氨酶升高，这时我们通常称为“肝炎”。持续存在的肝脏炎症有可能导致肝纤维化甚至肝硬化，因此需要积极的寻找并干预隐藏在转氨酶升高背后的病因，避免肝脏受到持续的损伤。保肝降酶药物是治疗的辅助，而不应当是治疗的主流甚至全部。

我们俗称的肝功能试验指的是肝脏生物化学试验，除了血清丙氨酸氨基转移酶（ALT），天门冬氨酸氨基转移酶（AST）之外，还包括碱性磷酸酶（ALP），γ谷氨酰转肽酶（GGT），胆红素（BIL），白蛋白（ALB）和凝血酶原时间（PT）等指标。这些指标不能孤立的看待，单一指标的异常并不一定是肝脏的问题，需要互相结合，综合判断。通过对肝功能试验相关指标的分析，有助于判断肝损伤的有无，推测引起肝损伤的可能病因，评估肝病的严重程度和预后，监测肝病的进展和治疗效。临床上经常用于评估肝脏储备功能和肝脏疾病严重程度。常用于肝硬化患者的Child-Pugh肝功能分级标准包含了肝功能试验中的胆红素，白蛋白和凝血酶原时间这三个项指标（另外两项是肝性脑病和腹水），根据异常的程度分别赋予各指标不同的积分（1分，2分，3分），各项指标的积分累加数值越高代表了肝脏损害越严重，肝脏储备功能越差。终末期肝病模型中包含了胆红素和国际标准化比值（INR），可以评估终末期肝病患者的预期寿命。其中国际标准化比值是根据凝血酶原时间通过计算得到的。由此可见胆红素，白蛋白和凝血酶原时间可以在一定程度上反映出肝脏疾病的严重程度。除了肝脏疾病之外，其他的一些肝外疾病也可以引起这三个指标的升高，因此在用于评估肝脏疾病严重程度的时候需要互相参考，并结合特定的临床情景。